Latar belakang demikian, muncullah perlawanan-perlawanan dari beberapa kelompok sebagai bentuk sikap tak setuju dengan tindakan pemerintahan Jepang.
Beberapa contoh perjuangan bawah tanah antara lain adalah sebagai berikut:
1. Gerakan kelompok Amir Syarifuddin.
2. Gerakan kelompok Sutan Syahrir.
3. Kelompok Sukarmi.
4. Kelompok Pemuda Menteng 31.
5. Golongan Persatuan Mahasiswa.
6. Golongan Kaigun.